Sintetična genomika
Sintetična genomika je vrsta genskega inženiringa. Z njo se ustvarjajo geni, ki se v naravi nikoli ne pojavljajo.
Sintetična genomika ne uporablja naravnih genov. Uporablja lahko po meri zasnovane serije baznih parov. V prihodnosti bo morda uporabljala genske kode, ki niso sestavljene iz dveh baznih parov DNK, ki jih trenutno uporabljajo oblike življenja.
Sintetična genomika uporablja tehnike iz raziskav genetike. Raziskovalci lahko v velikem obsegu poceni in natančno izdelujejo dolge verige baznih parov. To jim omogoča izvajanje poskusov na genomih, ki v naravi ne obstajajo. Uporabljajo tudi zamisli o zlaganju beljakovin in vrhunske računalniške zmogljivosti.
Na tem področju deluje inštitut J. Craig Venter. Ekipo približno 20 raziskovalcev vodijo Nobelov nagrajenec Hamilton Smith, raziskovalec DNK Craig Venter in mikrobiolog Clyde A. Hutchison III. Venterjeva skupina je z rekombinacijo 25 prekrivajočih se fragmentov sestavila polsintetični genom bakterije Mycoplasma genitalium. To je bilo izvedeno v enem samem koraku:
"Uporaba rekombinacije v kvasovkah močno poenostavi sestavljanje velikih molekul DNK iz sintetičnih in naravnih fragmentov."
Genetiki so izdelali prvi sintetični kromosom za kvasovke. "Gene v prvotnem kromosomu so nadomestili s sintetičnimi različicami in končni umetni kromosom so nato uspešno vgradili v celico kvasovk."
Ustanovljena so bila tudi druga podjetja, med njimi podjetje Synthetic Genomics (podjetje), da bi izkoristila številne komercialne možnosti uporabe po meri oblikovanih genomov.
Vprašanja in odgovori
V: Kaj je sintetična genomika?
O: Sintetična genomika je vrsta genskega inženiringa, ki ustvarja gene, ki se ne pojavljajo v naravi. Ne uporablja naravno prisotnih genov, temveč lahko uporablja po meri oblikovane serije baznih parov.
V: Kako deluje sintetična genomika?
O: Sintetična genomika uporablja tehnike iz genetskih raziskav za poceni in natančno ustvarjanje dolgih verig baznih parov v velikem obsegu. To raziskovalcem omogoča eksperimentiranje z genomi, ki v naravi ne obstajajo. Uporabljajo se tudi zamisli iz zlaganja beljakovin in vrhunske računalniške zmogljivosti.
V: Kdo vodi raziskave na tem področju?
O: Ekipo približno 20 raziskovalcev inštituta J. Craig Venter Institute vodijo Nobelov nagrajenec Hamilton Smith, raziskovalec DNK Craig Venter in mikrobiolog Clyde A. Hutchison III.
V: Kaj je Venterjeva skupina že dosegla?
O: Skupina Venter je z rekombinacijo 25 prekrivajočih se fragmentov v enem koraku z uporabo tehnologije rekombinacije kvasovk sestavila polsintetični genom bakterije Mycoplasma genitalium. Poleg tega so genetiki izdelali prvi sintetični kromosom za kvasovke, tako da so gene v prvotnem kromosomu nadomestili s sintetičnimi različicami in ga uspešno integrirali v celico kvasovk.
V: Ali obstajajo kakšne komercialne aplikacije za po meri zasnovane genome?
O: Da, podjetja, kot je Synthetic Genomics, so bila ustanovljena, da bi izkoristila številne komercialne uporabe po meri oblikovanih genomov.
V: Katere vrste poskusov je mogoče izvajati s sintetično genomiko?
O: Poskuse je mogoče izvajati na genomih, ki v naravi ne obstajajo, z uporabo tehnik sintezne genomike, kot je poceni in natančno ustvarjanje dolgih verig baznih parov v velikem obsegu ali rekombinacija 25 prekrivajočih se fragmentov v enem samem koraku z uporabo tehnologije rekombinacije kvasovk.
