Alternativno izrezovanje
Alternativno spajanje omogoča, da DNK kodira več kot eno beljakovino. Spreminja sestavo eksonov v sporočilni RNK.
Pri alternativnem spajanju se eksoni predznačilne RNA, ki nastanejo pri transkripciji, med spajanjem RNA povežejo na različne načine.
Tako iz istega gena nastanejo različne zrele messenger RNA. Te se prevedejo v različne beljakovine. Tako lahko en sam gen kodira več beljakovin.
Alternativno spajkanje je pri evkariontih normalno. Močno poveča raznolikost beljakovin, ki jih lahko kodira genom. Pri ljudeh je ~ 95 % multieksonskih genov alternativno spajkanih.
Obstajajo različne vrste alternativnega spajanja: najpogostejša je preskok eksona. Pod določenimi pogoji ali v določenih tkivih je lahko ekson vključen v mRNA, v drugih pa je v mRNA izpuščen. Obstajajo aktivatorji spajanja, ki spodbujajo uporabo določenega mesta spajanja, in represorji spajanja, ki zmanjšujejo uporabo določenega mesta. Odkrivajo se nove vrste alternativnega spajanja.
Pri boleznih se pojavljajo nenormalne variacije v spajanju. Številne človeške genetske motnje so posledica različic spajanja. Nenormalne variante spajanja lahko prispevajo tudi k razvoju raka. Nefunkcionalni izdelki spajanja se običajno obravnavajo s posttranskripcijskim nadzorom kakovosti. To pomeni, da jih razrežejo encimi.
Pri alternativnem spajanju nastaneta dve izoformi proteina.
Vir raznolikosti
Alternativno spajanje (ponovna kombinacija različnih eksonov) je glavni vir genetske raznolikosti pri evkariontih. En gen Drosophile (DSCAM) se lahko alternativno spoji v 38.000 različnih mRNA.
Vprašanja in odgovori
V: Kaj je alternativno spajanje?
O: Alternativno spajanje je proces, pri katerem se eksoni predznačilne RNA, ki nastanejo pri transkripciji, med spajanjem RNA povežejo na različne načine, zaradi česar nastanejo različne zrele sporočilne RNA istega gena, ki se prevedejo v različne beljakovine.
V: Kako pogosto je alternativno cepljenje?
O: Alternativno spajanje je pri evkariontih običajno in močno poveča raznolikost beljakovin, ki jih lahko kodira genom. Pri ljudeh je približno 95 % multieksonskih genov alternativno spajkanih.
V: Katere so nekatere vrste alternativnega spajanja?
O: Najpogostejša vrsta alternativnega spajanja je preskok eksona, pri katerem se lahko ekson vključi ali izpusti iz mRNA, odvisno od določenih pogojev ali tkiv. Obstajajo tudi druge vrste, kot so aktivatorji in represorji spajanja, ki spodbujajo oziroma zmanjšujejo uporabo določenih mest, odkrivajo pa se tudi nove vrste.
V: Kako nepravilne razlike v alternativnem spajanju vplivajo na zdravje?
O: Nenormalne spremembe v alternativnem spajanju lahko povzročijo genetske motnje in prispevajo k razvoju raka. Z nedelujočimi izdelki, ki nastanejo pri tem postopku, se običajno ukvarjajo posttranskripcijski nadzor kakovosti, kjer jih razrežejo encimi.
V: Katere vrste beljakovin lahko nastanejo z alternativnim spajanjem?
O: Z alternativnim spajanjem lahko en gen kodira več beljakovin, kar poveča raznolikost beljakovin, ki jih lahko kodira genom.
V: Kaj se zgodi, če zaradi alternativnega spajanja nastanejo nedelujoči izdelki?
O: Če so zaradi alternativnega spajkanja nastali nedelujoči izdelki, jih običajno obravnava posttranskripcijski nadzor kakovosti, pri katerem jih razrežejo encimi.
