Miksobakterije (sluzaste bakterije): biologija, vedenje in vloga v tleh
Miksobakterije (pogosto imenovane sluzaste bakterije) so skupina bakterij, ki običajno živijo v zemlji. Hranijo se z netopnimi organskimi snovmi in so znane po relativno velikih genomih — v primerjavi z mnogimi drugimi bakterijami imajo zelo velike genome. Miksobakterije spadajo v skupino delta proteobakterij, veliko skupino gramnegativnih oblik.
Miksobakterije se premikajo z drsenjem po površini. Potujejo v rojih s številnimi celicami, ki jih skupaj držijo medcelični molekularni signali. Roj izloča zunajcelične encime za prebavo hrane. S tem se poveča učinkovitost prehranjevanja.
Življenjski cikel in socialno vedenje
V normalnih razmerah miksobakterije živijo kot posamezne, drseče celice, ki iščejo in prebavljajo organske delce ter druge mikroorganizme. Ko je hrane dovolj, rastejo in se razmnožujejo. Ob pomanjkanju hranil pa sprožijo dramatično, usklajeno vedenje: celice komunicirajo z različnimi signalnimi molekulami (pri modelni vrsti Myxococcus xanthus so opisani na primer t. i. A- in C-signali), začnejo se zbirati in oblikujejo tridimenzionalne strukture, imenovane plodna telesa ali roji. Znotraj teh struktur se del celic diferencira v odporne spore (myxospori), ki prenesejo neugodne razmere in se ob boljših razmerah ponovno razcvetijo v vegetativne celice.
Miksobakterije uporabljajo vsaj dve vrsti gibanja: A-motility (po posameznih celicah, imenovano tudi "adventurous" gibanje) in S-motility (socialno gibanje, kjer sodelujejo pili in sinhronizacija med celicami). Socialno vedenje vključuje izmenjavo signalov, tvorbo ekstracelularnih polisaharidov in kolektivno izločanje litičnih encimov, kar omogoča lov na druge bakterije in razgradnjo trdnejših organskih snovi.
Prebava, plenilstvo in metabolizem
Miksobakterije so učinkoviti predatorji drugih mikrobov. Roj skupaj izloča encime in tudi različne sekundarne metabolite, ki razgradijo celične stene plena in raztopijo organske snovi, da jih lahko posrkajo. Zaradi velikega genoma imajo številne geneske sklope za encime, transportne sisteme in regulacijske proteine, kar jim omogoča prilagodljivo in kompleksno vedenje pri iskanju in izrabi virov.
Vloga v ekosistemu in uporaba
Miksobakterije igrajo pomembno vlogo v tleh in drugih vodnih ter vlažnih ekosistemih: pomagajo pri razgradnji organskih materialov, preoblikovanju organskih snovi v oblike dostopne drugim organizmom ter uravnavanju populacij drugih bakterij in gliv. Zaradi svojega plenilskega načina življenja in sposobnosti tvorbe sekundarnih metabolitov so zanimive tudi v biotehnologiji — iz njih izvirajo spojine, ki bi lahko služile kot antibiotiki ali za druge farmacijske uporabe.
Raziskave in gojenje
Mnoge vrste miksobakterij so predmet osnovnih raziskav o večceličnosti, komunikaciji celic in razvojni biologiji mikroorganizmov. Modelna vrsta Myxococcus xanthus je še posebej dobro preučena. V laboratoriju jih gojimo na površinskih gojiščih, kjer lahko opazujemo drsenje in tvorbo rojev; pomanjkanje hranil na površini pogosto sproži agregacijo in razvoj plodnih teles. Zaradi kompleksnosti njihovega obnašanja in velikih genomov so raziskave lahko zahtevne, a hkrati zelo informativne.
Raznolikost in življenjski prostor
Miksobakterije so razširjene v vlažnih tleh, listnem opadu, gnilobi lesa in drugih bogatih organskih okolij. Obstaja široka taksonomska raznolikost z mnogimi rodovi in vrstami, vsaka z različnimi ekološkimi strategiami — od bolj samostojnih do zelo socialno usmerjenih oblik.
Skupaj so miksobakterije primer fascinantne meje med enoceličnim in večceličnim načinom življenja: delujejo kot posamezne bakterije, a hkrati lahko oblikujejo kompleksne, usklajene skupine z delitvijo dela, komunikacijo in razvojnimi programi, kar jih dela pomembne tako za ekosisteme kot za znanstvene in aplikativne raziskave.
Življenjski cikel
Ko primanjkuje hranil, se miksobakterijske celice združijo v plodove. Ti plodovi so različnih oblik in barv, odvisno od vrste.
V plodovih se celice razvijejo v zaobljene mikhospore z debelimi celičnimi stenami. Te miksospore, tako kot spore drugih organizmov, preživijo, dokler ni na voljo več hranilnih snovi. Nato se rast celic ponovno začne s skupino (rojem) miksobakterij in ne le z izoliranimi celicami. Podobni življenjski cikli so se razvili med amebami, ki se imenujejo celične sluzaste plesni.
Uporablja
Miksobakterije proizvajajo številne biomedicinsko in industrijsko uporabne kemikalije, kot so antibiotiki, in jih iznašajo zunaj celice. Nekatere miksobakterije se uporabljajo kot modelni organizmi za preučevanje razvoja. Na molekularni ravni začetek razvoja plodovk uravnava sRNA Pxr.