Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii je endosimbiotska gama proteobakterija. Ima najmanjši znani genom med vsemi bakterijami.
Vrsta je endosimbiont, ki je prisoten pri vseh vrstah žuželk, ki se prehranjujejo s floemskim sokom in so znane kot psyllidi. Endosimbiont se nahaja v specializirani strukturi, imenovani bakteriom.
Leta 2006 je bil genom enega seva Ca. C. ruddi, ki so ga sekvencirali na RIKEN na Japonskem in Univerzi v Arizoni. Genom je krožni kromosom s 159.662 baznimi pari in ima visoko gostoto kodiranja (97 %) s številnimi prekrivajočimi se geni in zmanjšano dolžino genov. Število predvidenih genov je bilo 182, kar je tudi najmanjše število doslej (NCBI-Genome). Zdi se, da številni geni, ki veljajo za bistvene za življenje, manjkajo, kar kaže na to, da je vrsta morda dosegla status organelov.
Za primerjavo, genom Mycoplasma genitalium, ki ima najmanjši genom med vsemi prosto živečimi organizmi, ima 521 genov.
Vprašanja in odgovori
V: Kaj je Candidatus Carsonella ruddii?
O: Candidatus Carsonella ruddii je endosimbiotska gama proteobakterija, ki je prisotna v vseh vrstah žuželk, ki se prehranjujejo s floemskim sokom in so znane kot psillide.
V: Kakšna je velikost genoma bakterije Candidatus Carsonella ruddii?
O: Genom Candidatus Carsonella ruddii je najmanjši znani genom katere koli bakterije in je krožni kromosom s 159 662 baznimi pari.
V: Koliko genov je predvidoma prisotnih v bakteriji Candidatus Carsonella ruddii?
O: Število predvidenih genov v Candidatus Carsonella ruddii je 182, kar je najmanj doslej (NCBI-Genome).
V: Kakšna je gostota kodiranja genoma Candidatus Carsonella ruddii?
O: Genom Candidatus Carsonella ruddii ima visoko gostoto kodiranja, ki znaša 97 %.
V: Kaj je bakteriom?
O: Bakteriom je specializirana struktura, v kateri se pri bakteriji Candidatus Carsonella ruddii pojavljajo endosimbionti.
V: Kaj manjka v genomu bakterije Candidatus Carsonella ruddii?
O: V genomu Candidatus Carsonella ruddii manjkajo številni geni, ki veljajo za bistvene za življenje, kar kaže na to, da je vrsta morda dosegla status organel.
V: Kako se genom Candidatus Carsonella ruddii razlikuje od genoma Mycoplasma genitalium?
O: Genom Mycoplasma genitalium, ki ima najmanjši genom med vsemi prosto živečimi organizmi, ima 521 genov, kar je bistveno več od števila predvidenih genov v Candidatus Carsonella ruddii.
