Zgodnja vladavina
Viljem se je odločil, da bo kronan na božič. Deloma zato, ker je menil, da bodo Angleži ob tem velikem prazniku redkeje povzročali nemire. Dobra izbira je bila tudi zato, ker je verjel, da je bila Božja volja, da postane kralj. Zdaj je Viljem postal kralj in je nekaj mesecev preživel v Angliji. Nato se je vrnil v Normandijo in Anglijo prepustil v roke dvema sposobnima možema. To sta bila njegov polbrat Odo, škof v Bayeuxu, in Viljem FitzOsbern. Odo je postal grof Kenta, FitzOsbern pa grof Hereforda. Preostali trije angleški grofje so ostali na svojem mestu. Ko je Viljem odplul nazaj v Normandijo, je bilo z njim veliko njegovih privržencev. Veliko njegovih vojakov, ki so bili plačani, in drugih, ki jih je želel spremljati. Med njimi sta bila zlasti angleški nadškof Stigand in Edgar Atheling. S seboj je vzel tudi preostale tri angleške grofe, Edwina, Morcarja in Waltheofa. To je storil zato, da nihče od njih ne bi mogel sprožiti upora, medtem ko je bil odsoten. Viljem je imel doma svoje dolžnosti, za katere je moral skrbeti. Prav tako se je moralo vrniti veliko njegovih vojakov, da bi vojvodina ostala varna.
Ko se je Viljem decembra 1067 vrnil v London, je začel ugotavljati, kakšne težave so se pojavile, ko ga ni bilo doma. Hertfordshire so napadli Merciani. Exeter ni sprejel vladavine novega kralja. Viljem je zbiral denar v vseh delih Anglije, ki so bili pripravljeni plačati. Pozval je tudi k angleškim dajatvam. Exeter se je predal, ko je bil eden od talcev oslepljen. Ko si je podredil Devon in Cornwall, se je zdelo, da je vse mirno. V Winchester je Viljem poslal po svojo ženo Matildo, ki je bila tam na binkošti okronana za angleško kraljico.
Do poletja je izbruhnilo še več uporov. Hkrati so drugi bežali iz Anglije. Edgar Atheling je skupaj z materjo in sestrami odšel na Škotsko, kjer so jih sprejeli. Na severu so se v okolici Yorka zbirale močne protinormanske skupine. Grof Edwin in njegov brat Morcar sta zapustila Viljemov dvor in se pridružila upornikom na severu. Viljem je nato zgradil grad v Warwicku. Zaradi tega so se grofje in drugi podredili Viljemu. Sledili so drugi gradovi. Viljem je nato vstopil v York, kjer so se mu drugi podredili. Nato se je pogajal s škotskim kraljem, da bi preprečil vdore v Anglijo s severa. Vendar njegova kampanja na severu ni bila tako učinkovita, kot je mislil. Leta 1069 je druga vstaja prerasla v vojno. Možje, ki jih je Viljem pustil na čelu, so bili ubiti. Majhna normanska vojska se je zadržala v Yorku, ko jim je Viljem priskočil na pomoč. Po izgradnji drugega gradu je Viljem vodenje prepustil grofu Williamu FitzOsbernu. Naslednjih pet mesecev je bil sever miren. Toda severnoangleški voditelji so poslali sporočilo kralju Sweinu na Dansko in mu ponudili krono, če bo premagal Normance. Swein je v Anglijo poslal dansko ladjevje.
Poleti leta 1069 se je ob obali Kenta pojavilo dansko ladjevje. Gibala se je proti severu in med potjo napadala obalo. Viljem in njegova vojska sta na jugu varovala pred morebitnimi vdori. Nazadnje se je ladjevje pridružilo angleškim upornikom na bregovih reke Humber. Vsi preostali angleški grofje so zapustili Viljema in se pridružili združenim angleško-danskim silam. Napotile so se proti normanski posadki v Yorku in pobile vse, razen nekaj žensk in otrok. Tudi Viljemu Maletu, Normanu, ki je živel v Angliji pred letom 1066, je bilo prizaneseno.
Harrying na severu
Viljemova severna vojska je bila uničena in York je bil v ruševinah. Istočasno so v Walesu in jugozahodni Angliji izbruhnili manjši upori. Viljem je vedel, da je v težavah. Najprej je sklical vse svoje poveljnike in vojake, da bi združil svoje sile. Kralj je vedel, da se mora z manjšo vojsko spopasti z eno skupino upornikov naenkrat. Poslal je Viljema FitzOsberna in Briana Bretonskega, da se spopadeta z Exeterjem. Viljem se je sam boril z vojsko, ki se je pomikala z vzhoda. V obeh primerih so bile normanske vojske uspešne. Zdaj je napadel severne vojske, ki so uničile York. Vendar mu ni uspelo priti dlje na sever kot do Pontefracta. Po več tednih poskusov je Viljem podkupil dansko ladjevje, da se je za zimo umaknilo iz Yorka. Ta je privolila in se vrnila v ustje reke Humber ter tam prezimila. Viljem se je zdaj lahko premaknil do Yorka. Tam je obnovil gradove. Nato je ukazal, naj se njegove sile razporedijo in uničijo vse, kar je bilo koristno za prehranjevanje angleške in danske vojske. Posledica tega je bila vsesplošna lakota, zato so se ljudje z območja odselili ali pa so umrli od lakote. To je bilo Viljemovo zloglasno nadlegovanje severa. Rezultat vsega tega je bila predaja angleških grofov in večine upornikov v Angliji. Nekaj preostalih skupin je Viljemova vojska hitro zatrla. Vendar se je ena skupina izkazala za bolj trmasto. Ta je bila v Chestru in po prisilnem pohodu pozimi jih je Viljem presenetil, še preden so bili pripravljeni. Po njihovi kapitulaciji je tam zgradil še dva gradu, nato pa se je vrnil v Winchester.
vladanje Angliji in Normandiji
Viljemu nikoli več ni bilo treba opustošiti grofije, kot je to storil v Yorkshiru. Spopadel se je z glavnimi grožnjami svoji vladavini, vendar je nekatere rešil le delno. Danska flota se je vrnila leta 1070, tokrat pod vodstvom kralja Swena. Na otoku Ely so se pridružili majhni skupini upornikov, ki jih je vodil Hereward Wake. Viljem je ponovno podkupil Dance, da so odšli, nato pa se je spopadel z uporniki. Za Herewarda ni bilo nikoli več slišati.
Viljem je moral zdaj vladati tako Angliji kot Normandiji. Ugotovil je, da mora biti navzoč, da ima stvari pod nadzorom. Ko je bil v Normandiji, so v Angliji pogosto izbruhnile težave. Ko je bil v Angliji, je Normandiji vladala njegova žena Matilda. Toda Fulk Rechin, novi grof Anjouja, je Maino izvzel iz Viljemovega nadzora. Viljem jo je moral leta 1073 vzeti nazaj.
Leta 1082 je Viljem aretiral svojega polbrata Oda, škofa v Bayeuxu in grofa Kenta. Razlogi so nejasni, vendar je Odo poskušal zbrati vojsko za pohod na Rim. Njegov načrt je bil postati naslednji papež. Viljem mu je sodil na otoku Wight. Poleg drugih zločinov je poskušal zbrati vojsko med Viljemovimi vojaki. Kot je poudaril Viljem, so bili potrebni za obrambo Anglije. Odo je protestiral, da mu ne more soditi niti kralj. Kot škof bi mu lahko sodil le papež. Viljem je odgovoril, da ni zasegel škofa, ampak svojega grofa, ki ga je pustil na oblasti v času svoje odsotnosti. Odo je bil do konca življenja zaprt v Normandiji.
Leta 1083 je umrla kraljica Matilda in bila pokopana v Caenu. Bila sta si zelo blizu in sta se razhajala le glede svojega sina Roberta Curthoseja. Robert se je večkrat uprl očetu, vendar je ohranil stike z materjo. To je povzročilo razdor med njima. Francoski kralj Filip I. je imel težave s tem, da bi njegov vazal postal kralj, kot je bil sam, zato je Viljemu zameril. Ko se je Robert Curthose uprl očetu, ni bil dovolj močan, da bi se sam spopadel z Viljemom, zato mu je kralj Filip pomagal.
Poleti leta 1085 je Viljem izvedel, da Danski kralj Kanut IV. pripravlja ladjevje za odhod proti Angliji. Viljem se je jeseni vrnil v Anglijo s številnimi vojaki. Moral jih je plačati in nahraniti, kar je bilo zelo drago. Morda se je takrat zavedel, da nima evidence o tem, kaj mu kot kralju dolgujejo. Ni vedel, ali pobira vse davke, ki so mu pripadali.
Domesday Book
Na božičnem dvoru v Gloucestru leta 1085 je Viljem zahteval, naj se v vseh delih Anglije opravi velika raziskava. Kralj je želel vedeti, koliko ljudi živi v njegovem [kraljestvu|[kraljestvu]]. Želel je vedeti, kolikšna je velikost vsake nepremičnine, koliko je vredna in koliko dohodka prinaša. Takšne raziskave v Angliji še ni bilo. Bila je edinstvena po svojih podrobnostih in prispevku k angleški zgodovini. Domesday Book je bila prva javna knjiga v Angliji.
Besedilo knjige je razdeljeno na dva zvezka. Prvi je zajemal enaintrideset okrožij. Zaradi svoje velikosti je bil imenovan "Veliki Domesday". Drugi je zajemal grofije Essex, Norfolk in Suffolk in se je imenoval "Mali dan". Dejstva je zapisovalo več komisij, ki so jih sestavljali škofje in grofje. Vsaka skupina je zbrala podatke o več grofijah. Viljem je 1. avgusta 1086 prejel obsežno zbirko pisnih podatkov. To je postala knjiga Domesday Book, ki pa še skoraj stoletje ne bo vezana v knjige.
Zadnja leta
William je umrl v Rouenu v Franciji zaradi poškodb, ki jih je dobil, ko je padel s konja, ki ga je imel v lasti.