Zasnova
Zamisel za javno univerzo v Kansas Territory je bila prvič omenjena s Territorial guverner Andrew Reeder julija 3, 1855. V govoru članom prvega teritorialnega zakonodajnega telesa je dejal: Reeder je dejal: "Razglabljanje o nujnosti splošne izobrazbe za oblikovanje dobre vlade," je dejal zakonodajalcem, "bi bilo danes pretirano delo, zato zadevo prepuščam v vaše roke in sem prepričan, da bo deležna pozornosti, ki si jo zasluži." Po njegovem govoru se je zasedanje odzvalo z vzpostavitvijo sistema splošnih šol za ozemlje. Odobrili so tudi ustanovno listino za "univerzo ozemlja Kansas", ki naj bi jo zgradili v Douglasu v Kansasu (blizu današnjega Lecomptona). Vendar ta predlagana univerza ni bila nikoli zgrajena.
Prebivalci Lawrence so najprej razmišljali o odprtju zasebne Free-State college v mestu, ko je bil prvič naseljen. To je bilo poleti leta 1854. Tisto jesen je eden od članov Družbe za pomoč emigrantom iz Nove Anglije Charles Robinson povedal blagajniku Amosu Adamsu Lawrenceu, da bodo prebivalci Lawrencea čim prej ustanovili kolidž. Ta naj bi bila na vrhu grebena Hogback Ridge (pozneje znanega kot Mount Oread). Do leta 1856 še ni bila ustanovljena nobena zasebna šola za Lawrence. Vendar so prebivalci Lawrencea še vedno upali, da jo bodo ustanovili. Prav tako so začeli upati, da bi se lahko pozneje spremenil v državno univerzo. Na božični dan leta 1856 je skupina pomembnih prebivalcev Lawrencea potrdila predlog zakona poslovnega odbora. V njem je pisalo, da je napočil čas za ustanovitev univerze v Lawrenceu. Izbranih je bilo petnajst upraviteljev, ki so vodili kolegij. Takoj so izbrali odbor, ki je zaprosil kongres za zemljišče. Ocenjeno je bilo, da bo potrebnih 100.000 dolarjev, da se bo kolegij lahko začel ustrezno razvijati. Menili so tudi, da bo treba skoraj ves ta denar zbrati zunaj ozemlja Kansasa. Teritorialni zakonodajalec je januarja 1859 ustanovil zasebno "univerzo Lawrence". Vendar ljudem ni nikoli uspelo ustanoviti zasebne visoke šole v Lawrenceu.
Ustanovitev
leta 1859, v ustavi Wyandotte - ustava, ki je Kansas postal država z - deli so bili napisani ustvariti državno univerzo. Na prvem zasedanju državnega zakonodajnega zbora Kansasa leta 1861 je bil sprejet predlog zakona o ustanovitvi državne univerze v Manhattnu v Kansasu. Uporabili so sredstva obstoječe univerze Blue Mont Central College. Vendar je guverner Charles Robinson iz Lawrencea na zakon vložil veto. Poskus preglasovanja veta v zakonodajnem zboru je propadel za dva glasova. Leta 1862 je z enim glasom propadel še en predlog zakona, po katerem naj bi bila v Manhattnu državna univerza. Država je 16. februarja 1863 sprejela ponudbo Manhattna, da mu podari stavbo in zemljišče Blue Mont College, in na tem mestu ustanovila državno univerzo, ki podeljuje zemljišča. Ta je postala državna univerza v Kansasu.
Vendar pa je zakonodajalec dejal, da je Manhattan je land-grant institucija je drugačen od tega, kar "državna univerza" je. 20. februarja 1863 je guverner Kansasa Thomas Carney podpisal zakon o ustanovitvi državne univerze v Lawrenceu. V zakonu je pisalo, da če bi Lawrence želel imeti univerzo, bi moral Lawrence dati 15.000 dolarjev v darilni sklad in prostor za univerzo. Kraj bi moral biti v mestu ali v njegovi bližini, velik pa bi moral biti vsaj štirideset akrov (160 000 m²). Če Lawrence tega ne bi storil, bi univerzo namesto Lawrencea dobila Emporia.
Kraj, izbran za univerzo je bil hrib znan kot Mount Oread ali Hogback Ridge. Bil je v lasti nekdanjega guvernerja Kansasa Charlesa L. Robinsona. Robinson in njegova žena Sara sta 40 akrov (160.000 m2 ) veliko območje prodala državi Kansas v zameno za zemljišče na drugem mestu. Dobrodelnež Amos Adams Lawrence je dal 10.000 dolarjev od potrebnega sklada za donacije. Prebivalci Lawrencea so preostala sredstva zbrali z izdajo menic, ki jih je podprl guverner Carney. 2. novembra 1863 je guverner Carney izjavil, da je Lawrence izpolnil pogoje za pridobitev državne univerze. marca 1 1864 je bila uradno ustanovljena Univerza v Kansasu.
Prvi sestanek upravnega odbora šole je bil marca 1865. To je dogodek, od katerega je datirana ustanovitev univerze. Pozneje istega leta se je začela gradnja prve stavbe univerze (Old North College). 19. julija 1866 je upravni odbor izvolil prve tri člane fakultete KU.
Univerza v Kansasu se je uradno odprla septembra 12, 1866. V pripravljalni šoli je bilo vpisanih 26 deklet in 29 fantov. Šola je leta 1869 začela poučevati na univerzitetni ravni. Prvi razred (s štirimi študenti) je na univerzi diplomiral leta 1873. Bila je ena od prvih javnih visokih šol v Združenih državah Amerike, ki je enakopravno sprejemala ženske in moške.
Iz teh začetkov, rivalstvo z Kansas State, najstarejši javni kolegij v državi Kansas, začel.
V začetku sedemdesetih let 19. stoletja je bil študent pisatelj in novinar Frank Harris. V prvem zvezku svojih spominov (My Life and Loves, 1922) je opisal intelektualno ozračje, ki ga je v tistem času vladalo na univerzi. Dejal je, da je njene liberalne korenine v Novi Angliji prevzel konservativizem.
Aprila 1874 je izšla prva resna študentska publikacija šole, Observer of Nature. Marca 1878 je nekdanji kancler James Marvin vodil prvi projekt za polepšanje šolskega kampusa. Zasadili so več kot 300 dreves, vključno z območjem, ki je zdaj znano kot "Marvinov gaj".
"Rock Chalk Jayhawk"
Maja 1886 je profesor Edgar Henry Summerfield Bailey prvič predlagal vzklik, ki je postal "Rock Chalk Jayhawk, K.U.". Baileyjeva različica, ki je bila sprva ustvarjena za znanstveni klub KU, je bila "Rah, Rah, Jayhawk, KU", ki se je trikrat ponovila. Rahi so bili pozneje nadomeščeni z "Rock Chalk". To je prenos besede chalk rock, imena za apnenec, ki ga najdemo na gori Mount Oread, kjer je kampus Lawrence. Sčasoma je pesem postala znana po vsem svetu. Nekdanji ameriški predsednik Theodore Roosevelt je dejal, da je to "najboljše študentsko petje, kar jih je kdaj slišal". Leta 1920 je belgijski kralj zahteval, da se na olimpijskih igrah izvaja običajna ameriška univerzitetna pesem. Po razpravi so se športniki na igrah strinjali s skandiranjem Rock Chalk.